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[PC활용] 오픈 화학(Open Chemistry), Avogadro2, MoleQueue2 (BSD)

 

이번에 소개할 프로그램은 Open Chemistry 프로그램 중 하나인 아보가드로2(Avogadro 2)와 몰큐(MoleQueue2)에 대해서 소개하려고 한다.

이건 말 그대로 분자를 그리는 프로그램이다.

 


1. 라이센스(License)

 

 개방형 화학 프로젝트와 그 하위 프로젝트는 허용 가능한 3개 조항 BSD 라이센스로 라이센스가 부여됩니다.
 그것은 상업적인 제품을 포함한 무제한 사용을 허용한다. 이 라이센스는 OSI 승인 라이센스이며 참조용으로 아래에 복사본이 나와 있습니다.

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 본 소프트웨어를 사용하지 않는 경우 발생하는 법적 책임 또는 범위(해당 책임 또는 기타 책임 포함) 

 The Open Chemistry project, and its subprojects, are licensed under the permissive 3-clause BSD license.
 It allows unrestricted use, including in commercial products. This is an OSI approved license, with a copy shown below for reference.


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2. 프로젝트 소개

 

아래의 사이트에 접속하면, 이 프로젝트를 통해서 수행할 수 있는 작업들을 갤러리로 소개하고 있다.

http://www.openchemistry.org/gallery

 

 

그림 2-1. Gallery / OpenChemistry - 도도(Dodo)

 


3. 다운로드 및 설치하기(Avogadro 2)

 

오픈 화학 프로젝트 중 하나인 "Avogadro 2"는 아래의 사이트에서 다운받을 수 있다.

https://www.openchemistry.org/downloads/

 

 

그림 3-1. 아보가드로2 - 도도(Dodo)

 

다운로드를 받았으면 실행을 한다.

"다음" 버튼을 누른다.

 

 

그림 3-2. 아보가드로2 - 도도(Dodo)

 

라이센스에 관한 것이다. 읽어볼 수 있으면 읽어보고, "다음" 버튼을 누른다.

 

 

 

그림 3-3. 아보가드로2 - 도도(Dodo)

 

"동의함" 버튼을 누른다.

 

 

그림 3-4. 아보가드로2 - 도도(Dodo)

 

system Path에 관한 것이다. 설정을 하고 싶다면, 설정을 하도록 하고 "다음" 버튼을 누른다.

 

 

그림 3-5. 아보가드로2 - 도도(Dodo)

 

"다음" 버튼을 누른다.

 

 

그림 3-6. 아보가드로2 - 도도(Dodo)

 

시작메뉴에 프로그램을 생성할 거라면, 만들고 옵션 등을 선택하도록 한다.

"다음" 버튼을 누른다.

 

 

 

그림 3-7. 아보가드로2 - 도도(Dodo)

 

기다린다.

 

 

그림 3-8. 아보가드로2 - 도도(Dodo)

 

"마침"을 누른다.

 

 

그림 3-9. 아보가드로2 실행(Launch Avogadro2) - 도도(Dodo)

 

바탕화면에 아보가드로2가 설치되었다. 프로그램을 실행하면 그림 2-9처럼 실행이 되는 것을 알 수 있다.

 


4. 시연(Practice) / 아보가드로 1.90.0

 

아래의 영상은 아보가드로 1.90.0에 대한 시연 영상이다.

 

 

영상 4-1. 아보가드로2 시연 - 도도(Dodo)

 


5. 다운로드 및 설치하기(MoleQueue2)

 

 

오픈 화학 프로젝트 중 하나인 "MoleQueue2"는 아래의 사이트에서 다운받을 수 있다.

https://www.openchemistry.org/downloads/

 

다운로드 사이트는 소스포지에서 제공하고 있다.

 

 

그림 5-1. 소스포지(MoleQueue) - 도도(Dodo)

 

다운로드를 받았으면 아래의 그림처럼 창이 뜨는 것을 확인할 수 있다.

"다음"을 누른다.

 

 

그림 5-2. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)

 

라이센스 등에 관한 것을 읽어보고, "다음"을 누른다.

 

 

그림 5-3. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)

 

폴더 등의 경로에 관한 것이다. 잘 선택하고 "다음"을 누른다.

 

 

그림 5-4. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)

 

설치 위치를 지정한다. "다음"을 누른다.

 

 

그림 5-5. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)

 

시작 메뉴 폴더 등을 선택한다. "설치"를 누른다.

 

 

그림 5-6. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)

 

설치가 완료되는 것을 확인할 수 있다. "확인"을 누른다.

 

 

그림 5-7. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)

 

MoleQueue 실행 장면이다. 크게 이렇게 생긴 프로그램이다.

특별하게 많은 창으로 구성되어 있진 않는다.

 

 

그림 5-8. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)

 

 

그림 5-9. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)

 

 

그림 5-10. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)

 


6. 시연(Practice) / MoleQueue

 

이 프로그램에 대해서 몇 가지 시연을 하였다.

 

 

영상 6-1. MoleQueue2 시연하기

 

병렬(페레널 프로그래밍 또는 Parallel programming)처리 관련 프로그램으로 보인다.

다중 코어를 동작시켜서 작업을 수행하는 것으로 추정할 수 있다.

 

번호

구분

 세부 특징(추정)

 1

 로컬(Local)

 예1)
 - 코어2듀오만 해도 CPU 1개에 논리 코어는 4개로 이뤄져있다.

 - 이 자원을 사용하겠다는 의미로 해석할 수 있음.

 예2)

 - 물리적인 컴퓨터(Physical Computing)에서 CPU가 4개일 때는 4개의 자원 중 가상코어 등까지 포함해서 
    사용하겠다는 의미로 해석하면 된다.

2

 나머지

 - SSH로 연결해서 네트워크를 활용한 컴퓨터 자원을 사용하겠다는 의미로 해석하면 됨.

 


7. 개발자 프로젝트 참여하기

 

프로그래머들은 아래의 git 사이트에서 프로젝트를 내려받거나 참여할 수 있다.

 

http://wiki.openchemistry.org/Development

 

 


8. 참고자료(Reference)

 

1. License | Open Chemistry, Last Modified, Accessed by 2018-08-14, https://www.openchemistry.org/licensing/

2. Downloads | Open Chemistry, Last Modified, Accessed by 2018-08-14, https://www.openchemistry.org/downloads/

3. Gallery | Open Chemistry, Last Modified, Accessed by 2018-08-14, https://www.openchemistry.org/gallery/

4. Development | wiki.openchemistry.org, Last Modified 2015-03-25- 20:58, Accessed by 2018-08-14, http://wiki.openchemistry.org/Development

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