이번에 소개할 프로그램은 Open Chemistry 프로그램 중 하나인 아보가드로2(Avogadro 2)와 몰큐(MoleQueue2)에 대해서 소개하려고 한다.
이건 말 그대로 분자를 그리는 프로그램이다.
1. 라이센스(License)
개방형 화학 프로젝트와 그 하위 프로젝트는 허용 가능한 3개 조항 BSD 라이센스로 라이센스가 부여됩니다.
무단 전재 금지 다음 조건이 충족될 경우 수정 여부와 관계없이 소스 및 이진 형식으로 재배포 및 사용이 허용됩니다. |
The Open Chemistry project, and its subprojects, are licensed under the permissive 3-clause BSD license.
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2. 프로젝트 소개
아래의 사이트에 접속하면, 이 프로젝트를 통해서 수행할 수 있는 작업들을 갤러리로 소개하고 있다.
http://www.openchemistry.org/gallery
그림 2-1. Gallery / OpenChemistry - 도도(Dodo)
3. 다운로드 및 설치하기(Avogadro 2)
오픈 화학 프로젝트 중 하나인 "Avogadro 2"는 아래의 사이트에서 다운받을 수 있다.
https://www.openchemistry.org/downloads/
그림 3-1. 아보가드로2 - 도도(Dodo)
다운로드를 받았으면 실행을 한다.
"다음" 버튼을 누른다.
그림 3-2. 아보가드로2 - 도도(Dodo)
라이센스에 관한 것이다. 읽어볼 수 있으면 읽어보고, "다음" 버튼을 누른다.
그림 3-3. 아보가드로2 - 도도(Dodo)
"동의함" 버튼을 누른다.
그림 3-4. 아보가드로2 - 도도(Dodo)
system Path에 관한 것이다. 설정을 하고 싶다면, 설정을 하도록 하고 "다음" 버튼을 누른다.
그림 3-5. 아보가드로2 - 도도(Dodo)
"다음" 버튼을 누른다.
그림 3-6. 아보가드로2 - 도도(Dodo)
시작메뉴에 프로그램을 생성할 거라면, 만들고 옵션 등을 선택하도록 한다.
"다음" 버튼을 누른다.
그림 3-7. 아보가드로2 - 도도(Dodo)
기다린다.
그림 3-8. 아보가드로2 - 도도(Dodo)
"마침"을 누른다.
그림 3-9. 아보가드로2 실행(Launch Avogadro2) - 도도(Dodo)
바탕화면에 아보가드로2가 설치되었다. 프로그램을 실행하면 그림 2-9처럼 실행이 되는 것을 알 수 있다.
4. 시연(Practice) / 아보가드로 1.90.0
아래의 영상은 아보가드로 1.90.0에 대한 시연 영상이다.
영상 4-1. 아보가드로2 시연 - 도도(Dodo)
5. 다운로드 및 설치하기(MoleQueue2)
오픈 화학 프로젝트 중 하나인 "MoleQueue2"는 아래의 사이트에서 다운받을 수 있다.
다운로드 사이트는 소스포지에서 제공하고 있다.
그림 5-1. 소스포지(MoleQueue) - 도도(Dodo)
다운로드를 받았으면 아래의 그림처럼 창이 뜨는 것을 확인할 수 있다.
"다음"을 누른다.
그림 5-2. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)
라이센스 등에 관한 것을 읽어보고, "다음"을 누른다.
그림 5-3. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)
폴더 등의 경로에 관한 것이다. 잘 선택하고 "다음"을 누른다.
그림 5-4. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)
설치 위치를 지정한다. "다음"을 누른다.
그림 5-5. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)
시작 메뉴 폴더 등을 선택한다. "설치"를 누른다.
그림 5-6. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)
설치가 완료되는 것을 확인할 수 있다. "확인"을 누른다.
그림 5-7. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)
MoleQueue 실행 장면이다. 크게 이렇게 생긴 프로그램이다.
특별하게 많은 창으로 구성되어 있진 않는다.
그림 5-8. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)
그림 5-9. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)
그림 5-10. MoleQueue 설치하기(Installing the MoleQueue) - 도도(Dodo)
6. 시연(Practice) / MoleQueue
이 프로그램에 대해서 몇 가지 시연을 하였다.
영상 6-1. MoleQueue2 시연하기
병렬(페레널 프로그래밍 또는 Parallel programming)처리 관련 프로그램으로 보인다.
다중 코어를 동작시켜서 작업을 수행하는 것으로 추정할 수 있다.
번호 |
구분 |
세부 특징(추정) |
1 |
로컬(Local) |
예1) - 이 자원을 사용하겠다는 의미로 해석할 수 있음. 예2) - 물리적인 컴퓨터(Physical Computing)에서 CPU가 4개일 때는 4개의 자원 중 가상코어 등까지 포함해서 |
2 |
나머지 |
- SSH로 연결해서 네트워크를 활용한 컴퓨터 자원을 사용하겠다는 의미로 해석하면 됨. |
7. 개발자 프로젝트 참여하기
프로그래머들은 아래의 git 사이트에서 프로젝트를 내려받거나 참여할 수 있다.
http://wiki.openchemistry.org/Development
8. 참고자료(Reference)
1. License | Open Chemistry, Last Modified, Accessed by 2018-08-14, https://www.openchemistry.org/licensing/
2. Downloads | Open Chemistry, Last Modified, Accessed by 2018-08-14, https://www.openchemistry.org/downloads/
3. Gallery | Open Chemistry, Last Modified, Accessed by 2018-08-14, https://www.openchemistry.org/gallery/
4. Development | wiki.openchemistry.org, Last Modified 2015-03-25- 20:58, Accessed by 2018-08-14, http://wiki.openchemistry.org/Development
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